Уильям Монахан начинал профессиональную карьеру как писатель и редактор. В 2000 году Warner Broth. купила права на экранизацию его романа "Light House: A Trifle", однако киноадаптация так и не появилась на свет. В 2001 году 20th Century Fox приобрела права на сценарий Монахана «Триполи», продюсером выступал Марк Гордон, режиссёром должен был стать Ридли Скотт. После знакомства с Монаханом Скотт пригласил его писать сценарий к своему фильму «Царство небесное», а «Триполи» лёг на полку. «Царство небесное» стало кинодебютом Монахана-сценариста.
Второй сценарной работой Монахана стал римейк гонконгского боевика «Двойная рокировка», написанный по заказу продюсерской компании Брэда Питта Plan B. Фильм «Отступники», снятый Мартином Скорсезе, принёс Монахану «Оскар» за лучший адаптированный сценарий. Всего картина получила четыре «Оскара»: кроме сценария — как лучший фильм, за лучшую режиссуру и лучший монтаж.
В 2010 на экраны выйдет режиссёрский дебют Уильяма Монахана — криминальный триллер «Лондонский бульвар».
